Arş. Gör.
MUHAMMED AHMED
SELÇUK

Başlama Tarihi : 12.09.2024
Bitiş Tarihi :
Proje Konusu : Türkiye'nin iklimi ve ekolojisi theileriosis, babesiosis ve anaplasmosis gibi enfeksiyonlara sebep olan etkenleri nakleden kene türlerinin gelişmesi için uygun olup, hayvancılığın çoğunlukla bilinçsiz şekilde yapılması ve hayvan hareketleriyle ilgili düzenlemelerin yetersiz olması sebebiyle bu tür hastalıklar geçmişten günümüze kadar yüksek oranlarda yayılış göstermektedir.Kenelerle nakledilen Babesia ve Theileria türleri koyun ve keçilerde piroplasmosise neden olmaktadır. Babesiosis, birçok evcil ve vahşi hayvan ile insanlarda görülen, Babesia türlerinin neden olduğu protozoer bir hastalıktır. Bugüne kadar 100'den fazla Babesia türü tanımlanmış ve dünyanın çeşitli yerlerinde omurgalılarda yeni türler keşfedilmeye devam etmektedir. Koyun ve keçilerde babesiosise neden olan türler Babesia ovis, Babesia motasi, Babesia crassa B. taylori, B. foliate ve yeni keşfedilmiş bir tür olan B. aktasi 'dir. Hastalık, özellikle tropikal ve subtropikal ülkelerde ruminantlarda endemiktir. Türkiye'de koyun ve keçilere kenelerle nakledilen bir diğer önemli piroplasm etkeni ise Theileria'dır. Koyun ve keçilerde theileriosis'e sebep olan türler Theileria lestoquardi (Syn: T. hirci), Theileria uilenbergi, Theileria luwenshuni, Theileria separate, Theileria recondita ve Theileria ovis'tir. Theileria lestoquardi, T. uilenbergi ve T. luwenshuni, koyun ve keçileri enfekte eden ve kötü huylu theileriosise neden olan oldukça patojen türlerdir. İkliminin sıcak oluşu ve dolayısıyla kenelerin yaşamaları için uygun ortam oluşturması bakımından Türkiye'nin Güneydoğu Anadolu Bölgesi Theileria, Babesia ve kene ile nakledilen diğer enfeksiyonlar açısından önemli bir konuma sahiptir. Bu bölgenin bazı illerinde kan protozoonu hastalıkları yönünden serolojik ve moleküler çalışmalar yapılmış fakat tüm bölgeyi kapsayan geniş çaplı bir çalışmaya rastlanmamıştır.Bu çalışmada ekonomik gelirin büyük çoğunluğunun hayvancılık ile sağlandığı Güneydoğu Anadolu Bölgesi'nde...
Proje Konum : Araştırmacı
Proje Türü : Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi
Güncelleme Tarihi : 2024-11-04 14:38:32

Başlama Tarihi : 18.03.2024
Bitiş Tarihi :
Proje Konusu :
Proje Konum : Araştırmacı
Proje Türü : Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi
Güncelleme Tarihi : 2024-06-13 22:19:42

Başlama Tarihi : 15.09.2023
Bitiş Tarihi :
Proje Konusu :
Proje Konum : Araştırmacı
Proje Türü : -Tübitak 1001
Güncelleme Tarihi : 2024-09-25 11:58:10

Başlama Tarihi : 03.02.2023
Bitiş Tarihi : 02.02.2025
Proje Konusu : Kistik Ekinokokkozis (KE), Echinococcus granulosus'un neden olduğu hem insan hem de hayvanları etkileyen dünyadaki en önemli zoonozlardan birisi olup, özellikle az gelişmiş ülkelerde, kırsal bölgelerdeki insan ve hayvanlarda sıkça rastlanmakta ve bu bölgelerde önemli ekonomik kayıplara neden olmaktadır. Siirt gibi küçükbaş hayvancılığın yaygın olarak yapıldığı bir bölgede gerek köpeklerde E. granulosus'un gerekse koyun ve keçilerde hidatik kistlerin yaygınlığı tam olarak bilinmemektedir. Bu çalışma, Siirt ilinde koyun, keçi ve köpeklerde E. granulosus'un moleküler epidemiyolojisi, tanısı ve genotiplendirilmesi amacıyla gerçekleştirilecektir. Projenin saha çalışması Siirt ili Merkez, Kurtalan, Baykan, Aydınlar ve Şirvan ilçelerinde gerçekleştirilecektir. Çalışmanın hayvan materyalini 250 koyun, 250 keçi ve en az 50 köpek oluşturacaktır. Bu çalışma için kullanılacak hidatik kist örnekleri için 12 ay boyunca haftada en az üç gün kesimhaneye gidilerek koyun ve keçi kesimleri takip edilecektir. Mezbahada pozitf olduğu belirlenen toplam 100 hayvanın başta karaciğer ve akciğerleri olmak üzere diğer iç organları hidatik kistler yönünden gerek inspeksiyon gerekse de palpasyonla muayene edilecek ve içi sıvı dolu kistlerden steril enjektöre kist sıvısı ve protoskoleksler alınacaktır. Belirgin kisti olan hayvanlardan serolojik testlerde kullanılmak üzere kan örnekleri de alınıp laboratuvara ulaştırılacak ve serumları ayrılıp porsiyonlandıktan sonra kullanılıncaya kadar -20 °C'de saklanacaktır. Köpek dışkı örnekleri için hem sahipli köpeklerden hem de belediyenin geçici hayvan barınağına getirilen sahipsiz köpeklerin rektumundan dışkı örnekleri alınacaktır. Bütün dışkı örnekleri -80 °C'de en az 10 gün bekletildikten sonra gDNA izolasyonu aşamasına geçilecektir. Serum analizleri için kanlar, koyun ve keçilerin v.jugularis'lerinden 5 ml'lik tüplere alınacak ve soğuk zincirde laboratuvara ulaştırılacaktır. Laboratuvarda 5000 rpm'de 5 dakika santri...
Proje Konum : Araştırmacı
Proje Türü : Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi
Güncelleme Tarihi : 2023-03-13 16:51:32

Başlama Tarihi : 10.01.2023
Bitiş Tarihi : 09.01.2025
Proje Konusu : Keneler dünya çapında bilinen ve hatta yeni yeni ortaya çıkan hastalıkların büyük bir bölümünün etkenlerinin yetkili vektörleridir. İnsan ve hayvan patojenlerini (viral, bakteriyel ve protozoon) taşıyabilirler. İnsan hareketleri ve göçmen kuşlar ile keneler ülkeden ülkeye hatta kıtadan kıtaya taşınabilir. Keneler birçok zoonoz hastalığın mükemmel vektörleridir. Bu çalışmada Siirt bölgesindeki farklı çiftliklerden 500 adet koyun ve 500 adet keçiden kene örnekleri toplanacaktır. Kene örneklerinden ticari Kit kullanılarak, üretici firmanın protokolüne göre DNA ekstraksiyonu yapılacaktır. Elde edilen DNA örneklerinden paraziter hastalıklar için PCR yapılacaktır. Daha sonra pozitif çıkan PCR ürünlerinden sekanslamaya uygun olanlardan çift yönlü sekans yapılacaktır. Daha sonra sekans sonuçlarına BLAST'lama yapılarak GenBanktaki ilgili referanslarla karşılaştırılacaktır.
Proje Konum : Araştırmacı
Proje Türü : Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi
Güncelleme Tarihi : 2024-01-14 17:36:02

Başlama Tarihi : 21.11.2022
Bitiş Tarihi : 27.09.2023
Proje Konusu : Babesiosis, tropikal ve subtropikal ülkelerde evcil ve vahşi hayvanların protozoon bir hastalığıdır. Küçük ruminantlardaki Babesia türlerinin çoğu sert keneler tarafından bulaşır ve enfekte hayvanlarda ateş, anemi, hemoglobinüri ve sarılığa neden olur. Koyunlarda ise özellikle B.ovis daha patojen olması nedeniyle önem arz etmektedir. Ayrıca Siirt ilinde koyunlarda B.ovis'in hem moleküler tespiti ve hem de karakterizasyonu hiç yapılmamıştır. Siirt merkez ve 6 ilçesi olmak üzere çeşitli işletmelerden elde edilen 500 adet koyundan toplanan kanlar hem PCR amaçlı EDTA'lı tüplere hem de biyokimyasal amaçlı serum tüplerine araştırma için toplanacaktır. Sonrasında laboratuvarda hem serumu elde edilecek hem de üreticinin talimatlarına göre Genomik DNA İzolasyon Kiti kullanılarak örneklerden DNA izole edilecektir. Ekstraksiyon sonrası 549 bp uzunluğundaki 18S rRNA gen bölgesinin konvansiyonel PCR kurulacaktır ve ardından pozitif bandlar sekansa gönderilecektir. Analiz sonucu gelen sekansların BLAST analizi, nükleotit farklılıkları ve filogenetik analizleri yapılacaktır. Ayrıca test sonuçlarına göre pozitif ve negatif serum örneklerinin alındığı hayvanlar klinik bulgularına göre değerlendirilerek, ilgili serum örneklerinde nitrik oksit (NO ), ileri oksidasyon protein ürünleri (AOPP), Süperoksit Dismutaz (SOD), Katalaz (CAT) analizleri yapılacaktır. Sonuç olarak B.ovis'in hem tedavisinin önemi hem de koruyucu tedbirlerin alınması gerektiğine dikkat çekilecektir.
Proje Konum : Araştırmacı
Proje Türü : Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi
Güncelleme Tarihi : 2023-09-30 11:50:40

Başlama Tarihi : 15.11.2022
Bitiş Tarihi : 14.02.2024
Proje Konusu : Coenurus serebralis, esas olarak koyun ve keçilerde bulunan ancak bazen sığırlarda, develerde, mandalarda, atlarda, maymunlarda ve hatta dünyanın birçok yerinde insanlarda bulunan köpek cestodu Taenia multiceps'in larva aşamasıdır. Oestrus ovis larvaları, Oestrus (Diptera: Oestridae) cinsine ait sineklerin neden olduğu ve çoğunlukla keçi ve koyunların boynuzlarında, frontal sinüslerinde ve burun boşluklarında yaşayan yaygın bir parazittir Bu projede Siirt bölgesindeki koyunlarda bulunan ve genel olarak koyunculuk ekonomisine önemli kayıplar yaşatan Coeunurus cerebralis ve Oestrus ovis'in prevalansının belirlenmesi ve parazit yüklerinin ortaya konması amaçlanmaktadır. Siirt bölgesindeki bir kasap işletmesinden 12 ay boyunca her hafta 10 adet koyun kafatası satın alınacak ve ardından tarih, cinsiyet, ırkı ve yaş bilgileri not edilerek sonra soğuk zincirde laboratuvara getirilecek ve +4 °C'de muhafaza edilecektir. Kafatasının sabitlemek için özel olarak yapılmış düzenek ile o gün içerisinde kafatasları düzenekte sabitlenecek ardından deri yüzülerek çıkarılacaktır. Sonrasında ilk olarak parietal kemiğe iki paralel kesit atılacaktır. Kemikler bir keski ve çekiç kullanılarak ayrıldıktan sonra beyin kısmı bir neşter yardımıyla ayrılarak çıkarılacak ve meninksler C.cerebralis kisti ve brüt patolojik lezyonlar yönünden iyice kontrol edilecektir. Sonrasında ise ön kemiğe sadece kaudal kesit atılacak ve burun boşluğu açılarak O.ovis larvaları yönünden muayene edilerek larvaların dönemleri belirlenecek ve toplanacaktır. Her iki numuneler bölgesel olarak kontrol edildikten sonra sayılacak ve salin çözeltisi ile yıkandıktan sonra %70'lik etanol ile tespit edilecektir. Veriler istatistikler için ki-kare testi ile analiz edilecek ve elde edilen veriler bilim dünyasıyla paylaşılacaktır.
Proje Konum : Araştırmacı
Proje Türü : Yükseköğretim Kurumları tarafından destekli bilimsel araştırma projesi
Güncelleme Tarihi : 2023-01-13 15:45:12

Başlama Tarihi : 15.09.2021
Bitiş Tarihi : 15.03.2023
Proje Konusu : Fasciolosis, dünya çapında yaygın, zoonotik öneme sahip bulaşıcı bir hastalıktır. Hastalık, karaciğerdeki iki ana patojen tür olan F. hepatica ve F. gigantica tarafından oluşturulur. Hastalığın teşhisinde temel olarak dışkı muayene yöntemleri önemli bir yer tutmakta ve kullanılan en yaygın yöntemlerin başında gelmektedir. Ancak yumurtalar yalnızca parazitin erişkin döneminde dışkıda görülebilmektedir. Dışkı muayenesiyle parazitin teşhisi en erken 13-14. haftalarda mümkün olmaktadır. Bu nedenle prepatent enfeksiyon teşhis edilmeden kalmaktadır. Bu nedenle mevcut proje önerisi ile F. hepatica enolaz geninin klonlanıp eksprese edildikten sonra elde edilecek rekombinant proteinin koyun fasciolosisinin tanısındaki etkinliğinin değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Bu amaçla erişkin F. hepatica’dan cDNA izolasyonunu takiben enolaz geninin çoğaltan primerler dizayn edilip PCR ile çoğaltılan gen bölgesi pET-28a(+) ekspresyon vektörüne klonlandıktan sonra protein ekspresyonu ve pürifikasyonu gerçekleştirilecektir. Bu protein bilinen pozitif serumlar kullanılarak westen blot ile gösterilecek ve takiben sahadan dışkı örnekleriyle birlikte toplanan 200 koyun serumunda ELISA ile teşhis gücü gösterilmeye çalışılacaktır. Böylelikle saha şartlarında kullanılabilir yüksek sensitiviteli bir tanı kiti oluşturulması planlanmıştır.
Proje Konum : Bursiyer
Proje Türü : -Tübitak 1002
Güncelleme Tarihi : 2024-01-14 17:36:38